平時對金相顯微鏡的各光學部分的表面，用干凈的毛筆清掃或用擦鏡紙擦拭干凈即行。在鏡片上有抹不掉的污物、油漬或手指印時，鏡片生霉、生霧以及長期停用后復用時，都需要先進行擦拭再使用。

擦拭范圍：目鏡和聚光鏡允許拆開擦拭。物鏡因結構復雜，裝配時又要專門的儀器來校正才能恢復原有的精度，所以不可以拆開擦拭。拆卸目鏡和聚光鏡時，要注意以下幾點：

①小心謹慎。

②拆卸時，要標記各元件的相對位置(可在外殼上劃線作標記)、相對順序和鏡片的正反面，以防重裝時弄錯。

③操作環(huán)境應保持清潔、干燥。拆卸目鏡時，只要從兩端旋出上下兩塊透鏡即可。目鏡內的視場光闌不能移動。否則，會使視場界線模糊。聚光鏡旋開后嚴禁進一步分解其上透鏡。因其上透鏡是油浸的，出廠時經過良好的密封，再分解會破壞它的密封性能而損壞。

擦拭方法：先用干凈的毛筆或吹風球除去金相顯微鏡鏡片表面的灰塵。然后用干凈的絨布從鏡片中心開始向邊緣作螺旋形單向運動。擦完一次把絨布換一個地方再擦，直至擦凈為止。如果鏡片上有油漬、污物或指印等擦不掉時，可用柳枝條裹上脫脂棉，蘸少量混合液擦拭。如果有較重的霉點或霉斑無法除去時，可用棉簽蘸水潤濕后粘上碳酸鈣粉(含量為99%以上)進行擦拭。擦拭后，應將粉末清除干凈。

金相顯微鏡鏡片是否擦凈，可用鏡片上的反射光線進行觀察檢查。要注意的是擦拭前一定要將灰塵除凈。否則灰塵中的砂粒會將鏡面劃起溝紋。